进行原理∶
当事人选择团体中的一些代表来扮演家中的成员，直觉地把他们摆设在某些位置上，然後随著代表们的反应以及老师的引导重新调整这个被扰乱的系统。海宁格发现到：人类的家族系统也有一个隐藏的规律在运作著，（海宁格称它作爱的序位）。人类家庭所发生许多负面的事件，包括家庭失和、身心疾病、伤害、自杀、意外、犯罪等，这些常常都是因为抵触了这个隐藏的规律所导致的，甚至有的会重覆地发生、从上一代延续到下一代。
「家族系统排列」正好就是在协助我们辨认出这个隐藏的规律、揭露问题的根源，解决生命中困难的问题，并且使它不会传递给无辜的下一代，而让生命恢复自然和谐的次序，让爱更加成长与流动。
个案实例∶
例1.
有一对伴侣相处五、六年，彼此相爱，但是从去年开始，虽没有重大的变故，但不融洽的地方愈来愈明显，那个男人一和其他的女人有接触，那个女人的不安全感就开始增加，对那个男人愈来愈不信任。他们做了许多沟通、努力却也没有多大改变，渐渐出现分手的危险。後来接受了「家族系统排列」才揭露出，原来因为他们曾经有过堕胎的小孩，但是他们却没有共同地承担、共同表示这个悲伤，所以我们在个案中让他们共同表示这个悲伤，并且在他们的心里给这个小孩一个位子. . . 很不可思议地，这对伴侣就能在另一个新的层面上，重新开始新的互动关系。
例2.
一对夫妻有两个孩子，父亲从小就很疼爱她们，亲子间也没有发生什麽大问题，但是不知什麽原因，大女儿总和父亲相处不好，心中对父亲有一种说不出的愤怒、甚至怨恨，他们也做了许多辅导、沟通，但总觉得只是处理了表面的情绪。後来在家族系统排列中才发现，原来这个女儿接收了父亲以前分手的女朋友的情绪，因为当初的分手对那个女人很不公平、而且造成伤害，那个女人对他仍存有怨恨，并未得到一个平衡的和解，所以这个女儿不知不觉接收了她的情绪，对父亲产生愤怒与怨恨。如此一来，我们用「家族系统排列」把问题根源清楚揭露出来，并且重新摆设它，让责任归属到它应该归属的地方，父亲与以前的女朋友达成一个平衡的和解，孩子回到属於她的位置，不久後这个女儿心中对父亲的愤怒与怨恨就彻底消失了。
所以，如果我们知道这些造成身心灵困扰、家庭问题的人或原因时，那还好处理，有许多方法可以用；但是，往往很多时候是我们不知道、或不觉得的人或事所造成的，用一般的方法比较难以奏效，但是「家族系统排列」却刚好可以针对这种情况，做妥善的处理。
